虽然受到萨迦寺所在地海拔高而带来的施工难度大、年有效工期短等因素的影响，但是萨迦寺主体维修工程目前已经全部完成。
萨迦寺维修工程总指挥格桑介绍说，萨迦寺整个维修工程有８大类、２４个子项目。其中主体工程维修项目包括主殿维修和城墙、角楼、敌楼维修加固和修复羊马墙及壁画保护维修。此外，维修还包括新建寺庙文物库房、僧舍、改造厕所，建设给排水、供电、消防、安防和避雷系统建设以及环境整治等。
内藏浩繁的文物和经书而被世人誉为中国的“第二敦煌”的萨迦寺维修隶属西藏三大文物维修工程。其追加后的实际总投资达到了９４７４万元，比计划投资８６６０万元增加了近１０００万元。
据介绍，萨迦寺主殿维修工程已于去年底完成，今年仅有部分女儿墙笾玛草实施返工作业。此外，城墙、角楼、敌楼、僧舍等古建筑维修已经完成；北寺考古工作已经结束，经书墙４万余部经书搬迁、整理、编目也已完成，并已搬回主殿归位。
